bases per tick :
2000
1000
500
200
100
50
20
10
5
2
kb first site :
homology :
M.domestica
sequence viewer :
( start, end )
( middle, total length )
= (
,
)
XM_001377082
Representative transcript
genome : 100,067,443 - 100,126,861 (59,419)
query : 1 - 4,280 (4,280/4,280)
26 exons
identity = 0.998
3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;0.962;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
0.957;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
RefSeq
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
Ortholog candidate
H.sapiens
(Human) : HIT000325484
Pan
sp. (Chimpanzee) : XM_001140931
Pongo
sp. (Orangutan) : CR859567
Macaca
sp. (Macaque) : AB168361
Mus
sp. (Mouse) : AF294327
Rattus
sp. (Rat) : ENSRNOT00000014859
Canis
sp. (Dog) : XM_542647
Equus
sp. (Horse) : XM_001492682
Gallus
sp. (Chicken) : BX935446
Danio
sp. (Zebrafish) : BC142883
Oryzias
sp. (Medaka) : ENSORLT00000007714
Tetraodon
sp. (Tetraodon) : GSTENT00007135001
Takifugu
sp. (Fugu) : SINFRUT00000165332
ENSMODT00000038162
genome : 100,068,312 - 100,077,818 (9,507)
query : 1 - 1,299 (1,299/1,299)
9 exons
identity = 0.995
3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;0.957;
0.994;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
ENSMODT00000010804
genome : 100,068,423 - 100,126,885 (58,463)
query : 1 - 3,348 (3,348/3,348)
26 exons
identity = 0.999
3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
0.957;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
Contig
100057152-100137151 F +