bases per tick :
2000
1000
500
200
100
50
20
10
5
2
kb first site :
homology :
M.domestica
sequence viewer :
( start, end )
( middle, total length )
= (
,
)
ENSMODT00000010614
Representative transcript
genome : 99,530,116 - 99,624,683 (94,568)
query : 1 - 1,296 (1,296/1,296)
10 exons
identity = 1.000
5'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000)3'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
Ortholog candidate
H.sapiens
(Human) : HIT000066580
Pan
sp. (Chimpanzee) : XM_001144072
Pongo
sp. (Orangutan) : ENSPPYT00000006473
Macaca
sp. (Macaque) : AB169372
Mus
sp. (Mouse) : AK154596
Rattus
sp. (Rat) : XM_001078875
Canis
sp. (Dog) : ENSCAFT00000009063
Equus
sp. (Horse) : ENSECAT00000007725
Bos
sp. (Cow) : ENSBTAT00000026195
Bos
sp. (Cow) : ENSBTAT00000045611
Gallus
sp. (Chicken) : AJ851775
Danio
sp. (Zebrafish) : BC054651
Oryzias
sp. (Medaka) : ENSORLT00000003560
Oryzias
sp. (Medaka) : ENSORLT00000022064
Tetraodon
sp. (Tetraodon) : GSTENT00026116001
Takifugu
sp. (Fugu) : SINFRUT00000131785
XM_001377033
genome : 99,530,119 - 99,624,683 (94,565)
query : 1 - 1,293 (1,293/1,293)
10 exons
identity = 1.000
5'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000)3'
coverage = 1.000
RefSeq
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
ENSMODT00000010616
genome : 99,530,152 - 99,619,394 (89,243)
query : 1 - 1,197 (1,197/1,197)
9 exons
identity = 0.988
5'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;0.849;1.000;
1.000)3'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
XM_001366189
Representative transcript
genome : 99,630,877 - 99,908,593 (277,717)
query : 1 - 3,138 (3,138/3,138)
26 exons
identity = 0.999
3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;0.954;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
RefSeq
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
Ortholog candidate
H.sapiens
(Human) : HIT000096781
Pan
sp. (Chimpanzee) : ENSPTRT00000024359
Pongo
sp. (Orangutan) : CR859100
Macaca
sp. (Macaque) : XM_001089334
Mus
sp. (Mouse) : BC030329
Rattus
sp. (Rat) : XM_224535
Canis
sp. (Dog) : XM_534170
Equus
sp. (Horse) : XM_001490998
Bos
sp. (Cow) : XM_610432
Danio
sp. (Zebrafish) : ENSDART00000065236
Danio
sp. (Zebrafish) : XM_001343826
Oryzias
sp. (Medaka) : ENSORLT00000008007
Oryzias
sp. (Medaka) : ENSORLT00000022112
Tetraodon
sp. (Tetraodon) : GSTENT00015798001
Tetraodon
sp. (Tetraodon) : GSTENT00026111001
Takifugu
sp. (Fugu) : SINFRUT00000175658
Takifugu
sp. (Fugu) : SINFRUT00000183114
XM_001366237
genome : 99,630,877 - 99,908,593 (277,717)
query : 1 - 3,138 (3,138/3,138)
26 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
RefSeq
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
ENSMODT00000010741
genome : 99,630,877 - 99,750,467 (119,591)
query : 1 - 2,967 (2,967/2,967)
25 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
ENSMODT00000010744
genome : 99,630,877 - 99,750,467 (119,591)
query : 1 - 3,066 (3,066/3,066)
27 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
ENSMODT00000038174
genome : 99,630,913 - 99,750,455 (119,543)
query : 1 - 2,901 (2,901/2,901)
26 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
ENSMODT00000038170
genome : 99,634,235 - 99,750,455 (116,221)
query : 1 - 2,859 (2,859/2,859)
27 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
XM_001377053
Representative transcript
genome : 99,965,619 - 99,966,239 (621)
query : 1 - 621 (621/621)
1 exon
identity = 1.000
5'(1.000)3'
coverage = 1.000
RefSeq
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
Contig
99569735-99969734 F +