bases per tick :
2000
1000
500
200
100
50
20
10
5
2
kb first site :
homology :
M.musculus
sequence viewer :
( start, end )
( middle, total length )
= (
,
)
ENSMUST00000050556
genome : 42,178,671 - 42,235,554 (56,884)
query : 1 - 10,646 (10,646/10,646)
27 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
NM_001081422
genome : 42,178,671 - 42,235,554 (56,884)
query : 1 - 10,646 (10,646/10,646)
27 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
RefSeq
BC024569
genome : 42,178,780 - 42,189,322 (10,543)
query : 6 - 1,746 (1,741/1,760)
5 exons
identity = 0.999
3'(0.999;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 0.997
DDBJ
AK122495
genome : 42,178,781 - 42,210,499 (31,719)
query : 1 - 5,540 (5,540/5,540)
17 exons
identity = 1.000
3'(0.999;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
DDBJ
BC061245
genome : 42,179,571 - 42,212,009 (32,439)
query : 1 - 1,838 (1,838/1,870)
3 exons
identity = 0.983
3'(0.998;0.800;0.996)5'
coverage = 0.998
DDBJ
AF013969
Representative transcript
genome : 42,179,820 - 42,210,795 (30,976)
query : 20 - 4,957 (4,938/4,957)
18 exons
identity = 0.999
3'(0.992;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;0.999)5'
coverage = 0.996
DDBJ
Ortholog candidate
H.sapiens
(Human) : HIT000001042
Pan
sp. (Chimpanzee) : XR_025352
Macaca
sp. (Macaque) : XM_001098928
Canis
sp. (Dog) : XM_536235
Equus
sp. (Horse) : ENSECAT00000010951
Monodelphis
sp. (Opossum) : ENSMODT00000001442
AK018479
genome : 42,181,213 - 42,183,036 (1,824)
query : 1 - 1,823 (1,823/1,823)
1 exon
identity = 0.998
3'(0.998)5'
coverage = 1.000
DDBJ
AK163093
genome : 42,199,955 - 42,208,444 (8,490)
query : 1 - 1,250 (1,250/1,250)
5 exons
identity = 0.999
3'(1.000;1.000;1.000;0.986;1.000)5'
coverage = 1.000
DDBJ
AK140021
genome : 42,210,088 - 42,213,040 (2,953)
query : 1 - 2,953 (2,953/2,953)
1 exon
identity = 0.999
3'(0.999)5'
coverage = 1.000
DDBJ
AK077824
genome : 42,213,270 - 42,235,554 (22,285)
query : 2 - 2,087 (2,086/2,088)
10 exons
identity = 0.992
3'(1.000;1.000)5'
coverage = 0.999
DDBJ
AK134590
genome : 42,213,754 - 42,235,531 (21,778)
query : 2 - 3,386 (3,385/3,386)
9 exons
identity = 0.999
3'(0.998)5'
coverage = 1.000
DDBJ
AC102858.11
42175307-42215306 F -
NCBI